一是，驳回起诉，是否定原告程序上的请求权；驳回诉讼请求，则是否定了原告的实体请求权。
二是，驳回起诉，意味着原告不符合法律规定的起诉条件，致使法院认为其不能起诉；驳回诉讼请求，则意味着原告已经符合了法律规定的起诉条件，但经过法院的实体审理之后，由于证据、依据等方面的原因，法院没有其诉讼请求。
三是，驳回起诉，表明案件并没有进入实体上的审理，因而只能用裁定的方式结案；驳回诉讼请求，则表明案件已经经过实体审理，因而必须用判决的方式结案。
四是，驳回起诉，指的是法院对于当事人的起诉实行登记立案制，如果当事人不符合《行政诉讼法》第49条的起诉条件的，裁定不予立案，立案后如果发现不符合起诉条件的，裁定驳回起诉。法院经过审查认为这两种生效裁定确有错误的，应当启动再审程序。
五是，驳回诉讼请求，指行政行为证据确凿，适用法律、法规正确，符合法定程序的，或者原告申请被告履行法定职责或者给付义务理由不成立的，法院会判决驳回原告的诉讼请求，这是法院对原告诉讼请求的否定。原告可以在规定的时限内上诉。根据一事不再理原则，如果原告仍然以相同的理由和事实根据再次起诉的，人民法院不予受理。
判决驳回诉讼请求，意味着法院维持了行政行为的效力，需要注意的是，法院判决行政机关行政行为合法的条件必须同时满足证据、依据和法定程序三个条件，缺少任何一个条件，法院都只能判决行政行为不合法，而不能判决驳回原告诉讼请求。
另外，驳回诉讼请求后的判决作出后，行政机关根据法律的规定，可以对原行政行为进行变更。法院经过审查认为原判决确有错误的，也应当启动再审程序。
